在处理大豆蛋白废水时，工厂需要注意以下几个方面：

1、预处理：由于大豆蛋白废水中可能含有高浓度的有机物、低聚糖、碳水化合物和无机盐类，预处理是必要的步骤。预处理可以通过格栅拦截大量废渣，用于回收，滤液进入调节池进行均质均量，减少后续工艺运行负荷。

2、pH调节：大豆蛋白废水的pH值较低，需要调节以达到厌氧菌所需要的最适pH范围。使用出水回流调节pH或使用石灰调节，以达到适宜的pH值，这对厌氧处理效果至关重要。

3、混凝气浮池处理：在混凝气浮池中投加聚合氯化铝和聚丙烯酰胺，进行曝气搅拌，以去除悬浮物和部分有机物。

4、 生化处理：生化处理是处理大豆蛋白废水的核心，通常采用“厌氧+好氧”联合工艺。厌氧段的沼气可作为清洁能源进行回用，同时去除大量COD，减少好氧段产泥量的同时降低其处理负荷，提高好氧段处理效率。

5、 脱氮除磷：大豆蛋白废水中含有高浓度的氨氮和磷酸盐，好氧处理单元要考虑脱磷脱氮，氨氮负荷需控制在较低水平，否则很难达到处理要求。

6、深度处理：根据排放标准以及出水水质等情况，设计合适的深度处理工艺，其主要目的是使各项污染物指标达到排放标准或者回用标准。

7、资源回收：充分回收利用大豆蛋白废水处理过程中产生的沼气，可以大大降低污水的运行成本。

8、工艺选择：选择适合的废水处理工艺，如UASB+A/O法，可以保证废水稳定达标排放，在削减大量污染物的同时，还可创造出极大的经济效益。

9、水质水量波动：大豆蛋白生产废水水质水量波动较大，需要设计调节池进行均质均量，减少后续工艺运行负荷。

10、环保责任：大豆蛋白污水处理不仅彰显了人类科技的进步，更体现了对环境的尊重与爱护。每一滴经过处理的水，都是对地球家园的承诺与责任。

综上所述，工厂在处理大豆蛋白废水时需要综合考虑预处理、pH调节、生化处理、脱氮除磷、深度处理等多个方面，以确保废水处理的稳定性和有效性。